纳芯微的客户群体涵盖了多个领域，包括信息通讯、消费电子、工业控制、汽车电子等。

在信息通讯领域，其隔离与接口芯片有较大营收占比。

消费电子领域是纳芯微产品的重要应用方向之一，例如信号感知芯片的部分营收就来自该领域。

工业控制领域也有纳芯微的客户，驱动与采样芯片有一定比例的营收来源于此。

在汽车电子领域，纳芯微的车规级芯片已实现批量装车，主要应用于燃油汽车发动机进气压力、空调压力系统和新能源汽车三电系统、热管理系统等。其车规级芯片业务的前五大客户包括无锡盛迈克传感技术公司、东风电驱动系统公司、浙江毅力汽车空调公司、无锡必创传感科技公司和铁城信息科技公司等。

据相关报道，华为也曾是纳芯微的重要客户之一。2018年纳芯微开始向华为直接供货，同时亚美斯通作为华为指定的经销商，以买断的方式从纳芯微购买芯片产品，再独立销售给华为。近3年纳芯微对华为直接或者间接的销售收入占总营收比例分别为0.36%、29.5%、22.98%，毛利占比为0.46%、35.92%、25.75%。但自2020年第四季度起，华为已暂停向纳芯微下达新订单。

另外，南京基尔诺和苏州明皜也曾是纳芯微的重要客户。南京基尔诺是纳芯微前五大客户中惟一的经销商，2021年上半年对其销售收入出现大幅增长。而苏州明皜与纳芯微合作关系长达8年。